隨著我國物流業的不斷發展，物流運作主體呈現多元化特點，由此產生了不同的物流運作模式。農產品的運輸與居民生活息息相關，農產品運輸品質會受到物流運作模式的影響。那么我國農產品物流運輸模式是怎樣的?
(一)自營物流模式
自營物流是指農產品生產者或相關企業(即包括物品的買方和賣方)借助于自身的物質條件自行組織物流活動的一種物流模式，它追求“大而全”“萬事不求人”，利用自有的設備去運營物流業務。在自給自足的“小農”思想影響下，“大而全，小而全”成為主要物流運作模式。在這一模式中，部分農業大戶或者農產品加工企業也會向運輸公司購買運輸服務或向倉儲企業購買倉儲服務，但這些服務只限于一次性或一系列分散的物流功能，而且是臨時性純市場交易的服務，物流公司并不按照企業獨特的業務程序提供獨特的服務，即物流服務與企業價值鏈是松散的聯系。
無論是我國的農產品流通企業或加工企業還是國外的大型農場，農產品自營物流還在被不斷采用，因為這種物流模式自身存在著諸多優點：①可以使農場主或農業公司對物流系統運作的全過程進行有效控制，對農產品的生產和銷售中的各個環節、市場對農產品的品種及質量要求、批發商以及零售商的經營能力等，都能掌握最詳盡的資料，以便能夠隨時調整自己的生產經營戰略;②可以使企業在改造經營管理結構和機制的基礎上充分利用原有物流資源，帶動資金流轉，為企業創造利潤空間;③可以使生產者或加工企業有效控制原材料的采購和產成品的銷售，不必就相關的運輸、倉儲、配送和售后服務的傭金問題進行談判，避免多次交易花費以及交易結果的不確定性，降低交易風險，減少交易費用;④可以使企業根據消費者需求和市場動向及時調整物流系統，提高服務水平，從而提高企業的品牌價值和競爭能力，同時還可避免因物流外包造成的企業商業秘密的泄露。
當然，自營物流也存在不少缺點：①自營物流必須具備與生產能力相符的運輸力量和倉儲容量，不僅給企業帶來資金方面的負擔，而且由于市場的不確定性還給企業帶來一系列風險，尤其是在銷售淡季，因為大量的運輸和倉儲設施閑置會造成極大浪費;②由于企業內部物流部門與其他許多相關部門存在一定聯系，而各部門之間又有著相互獨立的利益，致使管理難度加大;③物流的運作要求具備專業物流知識和實踐能力，企業選擇自營物流，往往會因為物流不是企業主營業務，不具備相應優勢而致使物流成本高、服務水平低。
(二)第三方物流模式
第三方物流是指成立專業的物流企業受賣方或買方委托，從事物流業務的一種物流外包模式。借助這一模式，既可以在專業化服務的條件下節約物流成本，提高物流效率，又可以使賣方企業或買方企業集中人力和物力搞好本企業的業氣最終實現雙贏目標。同自營物流相似，第三方物流同樣具有自身的優勢和劣勢。其優勢主要表現為：①農產品生產者或加工企業不僅可以通過第三方物流獲得自己本身沒有能力提供的或自己運行不具備任何優勢的物流服務，而且可以擺脫自建物流設施和信息網絡等物流專業設備所需的資金負擔;②第三方物流服務業存在規模經濟和范圍經濟，生產者或加工企業將物流外包給它們，比自身運營更有利于降低其運作成本，同時還可以幫助企業避免盲目投資，將資金用于適當用途;③由于第三方物流企業在信息網絡和配送節點上具有資源優勢，可以為消費者提供更滿意的服務，增強企業的市場感召力。
第三方物流的劣勢主要表現為：①由于將物流環節交給第三方來完成，往往使得貨主或者企業對物流的控制能力降低，甚至出現物流失控的風險;②由于第三方物流通常并不只是面對一個客戶，當信息在更多的企業間共享時，企業的商業秘密就可能被泄露;③還由于第三方物流商承擔著執行某些戰略的職能，通常對企業的戰略具有很深的認識，能夠得到與此有關的信息，致使企業核心戰略被泄露的風險增加。
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